JR東海道本線、湖西線と京都市営地下鉄東西線が乗り入れる駅です。
・JR東海道本線・湖西線
当駅で両路線は分離あるいは合流します。一部特急列車と新快速以下の全列車が停車します。
2面4線の構造をもつ地上駅です。
1番のりば 京都・高槻・新大阪・大阪・三ノ宮・西明石・姫路方面
2番のりば 京都・高槻・新大阪・大阪・三ノ宮・西明石・姫路方面
3番のりば 草津・野洲・米原・長浜方面 堅田・近江舞子方面
4番のりば 草津・野洲・米原・長浜方面 堅田・近江舞子方面
・改札画像
・駅名標
・京都市営地下鉄東西線
駅のすぐ近くに京阪山科駅があります。毘沙門堂への最寄り駅でもあります。
1面2線の構造をもつ地下駅です。
1番線 御陵・京都市役所前・烏丸御池・二条・太秦天神川方面
2番線 小野・醍醐・六地蔵方面
・改札画像
・駅名標
↑見やすさに配慮して設計されています。